由于制藥廠凈化車間尤其制劑車間有潔凈度要求，在藥廠設(shè)計上均考慮密閉（包括無窗廠房或有窗密閉操作的廠房）、空調(diào)等，潔凈廠房的布置與構(gòu)造上有很多不利于防火的因素，如工藝上經(jīng)常使用有機(jī)溶劑，并且廠房內(nèi)布置有大量貴重儀器設(shè)備，一旦發(fā)生火災(zāi)造成的損失極大，所以更應(yīng)重視防火安全問題。
（1）空間密閉。制劑車間內(nèi)部的空間封閉、圍護(hù)結(jié)構(gòu)氣密，相當(dāng)數(shù)量的無窗車間和有局部雙層密封窗的空間，不可開啟，保溫材料和室內(nèi)裝飾材料大量使用高分子合成材料，火災(zāi)發(fā)生后，燃燒中會產(chǎn)生大量的毒氣和濃煙，對于疏散和撲救極為不利。同時由于熱量無處泄放，火源的熱輻射經(jīng)四壁反射，室內(nèi)溫度會迅速升高，使室內(nèi)各部位材料縮短達(dá)到燃點(diǎn)的時間。當(dāng)廠房為無窗廠房時，一旦發(fā)生火災(zāi)時不易被外界發(fā)現(xiàn)，故消防問題更顯突出。
（2）平面布置曲折。潔凈車間平面布置曲折，潔凈區(qū)對外的總出入口少，增加了疏散路線上的障礙，延長了安全疏散的距離和時間，給人員疏散造成了困難。
（3）空調(diào)風(fēng)管密布。若干潔凈室通過風(fēng)管彼此相通，火災(zāi)發(fā)生時，特別是火災(zāi)剛起尚未發(fā)現(xiàn)而仍繼續(xù)送回風(fēng)時，風(fēng)管將成為火及煙的主要擴(kuò)散通道。