凈化車間工程技術已經(jīng)經(jīng)歷了半個多世紀的發(fā)展，隨著科學技術的發(fā)展，越來越多的行業(yè)和產(chǎn)品需要使用到凈化車間，并且在未來，產(chǎn)品對凈化車間的潔凈度的要求也會越來越來高，施工技術也會越來越復雜。目前，凈化車間使用的最多的行業(yè)是微電子、醫(yī)藥工業(yè)和食品工業(yè)這三大行業(yè)。
一、微電子
在這三大行業(yè)中，微電子是對凈化車間潔凈度要去最高的。特別是大規(guī)模和超大規(guī)模集成電路的發(fā)展，對潔凈度提出了非常高的要求。在集成電路的制造工藝中，集成度越大，對空氣中的微粒濃度要去就越高，因為對于超大規(guī)模集成電路來說，里面的元件是非常小的，就算是一粒灰塵都有可能造成電路短路。還有就是液晶顯示器制造同樣對潔凈度的要求非常的高。
二、食品工業(yè)
民以食為天，食品是人們最基本的需求，食品工業(yè)也是與人們生活最息息相關的行業(yè)。食品的包裝，食品的制造均需要用到食品廠凈化車間。特別是食品的無菌包裝，食品無菌包裝在保持食品色，香，味方面的優(yōu)勢遠遠超過高溫殺菌的罐裝食品，所謂無菌包裝，就是直接在凈化車間中完成的包裝工藝。隨著全球人口的增長，生活節(jié)奏的加快，早期的農(nóng)耕模式已經(jīng)不在適用于今天人們對食物的大量需求了，并且食物的花樣也是越來越多，所以流水線式的食品工業(yè)就非常重要了，而凈化車間的出現(xiàn)，保證了食品的質(zhì)量，同時也讓食品的保質(zhì)期更長。
三、醫(yī)藥工業(yè)
人這一生總是避免不了生老病死，只要生病就免不了進醫(yī)院，進醫(yī)院無非就是吃藥、輸液、手術。而這些藥物的生產(chǎn)和手術室建設都是需要凈化工程技術的。
（1）藥品生產(chǎn)制藥廠的生產(chǎn)環(huán)境對藥品的生產(chǎn)質(zhì)量、人體健康有重大關系。我國《藥品生產(chǎn)管理規(guī)范》（即GMP）早已在全國范圍內(nèi)實施，根據(jù)不同的工藝過程對生產(chǎn)環(huán)境提出了不同的潔凈度級別要求。對于原料藥、粉劑、針劑、片劑、大輸液的生產(chǎn)、灌裝等工藝，均已制定了潔凈區(qū)和控制區(qū)的潔凈標準。作為生物潔凈室，除對生物粒子（細菌數(shù)）有明確的限制條件之外，還限定空氣中塵埃粒子的含量。
（2）醫(yī)院白血病的治療室、燒傷病房、急性傳染病的預防病房、外科手術室，也必須根據(jù)具體條件采用潔凈技術，以防止空氣中細菌感染，對治療起到環(huán)境的保障作用。
（3）醫(yī)學科學實驗對于實驗動物飼養(yǎng)、遺傳工程等實驗醫(yī)學科學過程，也需配備潔凈環(huán)境，才能取得有效的成果。為此，以潔凈技術為重要手段的生物安全技術也得到迅速的發(fā)展。
三、其他行業(yè)
除了以上三大行業(yè)，航空航天、精密儀器、儀器儀表、精細化學及日用化工等行業(yè)都需要用到凈化車間。